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海外科研新進(jìn)展丨MIRA技術(shù)檢測諾如病毒可視化裝置

《Hybrid paper/PDMS microfluidic device integrated with RNA extraction and recombinase polymerase amplification for detection of norovirus in foods》

期刊名稱:《Applied and Environmental Microbiology》

影響因子:3.9

研究團(tuán)隊(duì):麥吉爾大學(xué)戴維斯夫人研究所病毒性疾病中心

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諾如病毒((HuNoV))屬于杯狀病毒科,可通過受污染的食物傳播,是引起急性胃腸炎的主要原因。

加拿大麥吉爾大學(xué)戴維斯夫人研究所病毒性疾病中心聯(lián)合發(fā)表了相關(guān)檢測研究。課題組開發(fā)了一種折紙微流控裝置,使用小鼠諾如病毒1(MNV-1)作為諾如病毒的替代品。該折紙微流控裝置通過試紙條吸收RNA,使用MIRA多酶恒溫快速核酸擴(kuò)增技術(shù)進(jìn)行RNA擴(kuò)增,以及試紙條橫向流動分析。整個檢測過程和結(jié)果可視化,檢測在35 min內(nèi)完成,且特異性100%、檢測限為200 PFU/mL。該裝置在偏遠(yuǎn)和資源環(huán)境中檢測農(nóng)業(yè)食品中的食源性病毒方面具有巨大的潛力。

實(shí)驗(yàn)方法

纖維素紙條吸收了MNV-1 RNA,隨后將其釋放到MIRA試劑中,RNA首先被逆轉(zhuǎn)錄成互補(bǔ)DNA(cDNA),然后擴(kuò)增成雙鏈DNA(dsDNA),接著探針與目標(biāo)序列進(jìn)行了特異性的結(jié)合,堿性四氫呋喃(THF)殘基被內(nèi)切酶IV裂解,使鏈被聚合酶延伸。擴(kuò)增子被捕獲,在T線上產(chǎn)生視覺信號。

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實(shí)驗(yàn)開發(fā)成果

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課題組開發(fā)了一種折疊的紙/PDMS微流控裝置,該裝置結(jié)合了核酸提取、等溫核酸擴(kuò)增、可視化檢測多種功能,可以無縫集成從樣品制備到MNV-1的終點(diǎn)檢測。

該微流控裝置在35 min范圍內(nèi)完成檢測,檢測限均為200 PFU/mL。并且每個微流控設(shè)備的成本計(jì)算為6.76美元,為課題組目前已知的所有檢測方法中最便宜的。


實(shí)驗(yàn)價值

課題組進(jìn)一步評估了這種微流控裝置在萵苣和覆盆子中檢測MNV-1的性能,將粗MNV-1 RNA提取物引入新鮮農(nóng)產(chǎn)品樣品中,不需要復(fù)雜的病毒RNA濃度和純化步驟,在生菜中檢測到170 PFU/g、在樹莓中檢測到230 PFU/g。

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而傳統(tǒng)的檢測食品中病毒的分子分析方法,PCR和qPCR需要高純度的病毒顆粒,這使病毒從食品基質(zhì)中的洗脫、濃度和純化變得復(fù)雜。并且傳統(tǒng)方法需要復(fù)雜、笨重和昂貴的設(shè)備,不適合在資源有限的環(huán)境中使用。

該裝置在快速檢測食品供應(yīng)鏈中的HuNoV和其他食源性病毒方面具有重要價值。

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