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MIRA結(jié)合Cas12a快速檢測兒童呼吸道疾病

急性呼吸道感染是兒童常見的呼吸道疾病,通常由病毒引起。呼吸道合胞病毒(RSV)和呼吸道腺病毒(ADV)是引起兒童急性呼吸道感染的兩種常見病原體。輕度者可引起常見的感冒癥狀,如咳嗽和流鼻涕,而嚴重者可出現(xiàn)嚴重的并發(fā)癥,如肺炎和中耳炎。根據(jù)世界衛(wèi)生組織的建議,病原體的檢測需要具備快速、準確、敏感、特異性的特點,不應(yīng)依賴專門的技術(shù)人員或大型儀器。因此,開發(fā)一種能夠滿足上述檢測要求的RSV和ADV的檢測方法尤為重要。

深圳兒童醫(yī)院兒科研究所的馬東禮主任課題組在《Scientific Reports》期刊上發(fā)表文章《A multiplex recombinase polymerase amplification assay combined with CRISPR/ Cas12a for the detection of respiratory syncytial virus and respiratory adenovirus》,影響因子4.6。

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研究概述

多酶恒溫快速核酸擴增技術(shù)MIRACRISPR/Cas檢測系統(tǒng)相結(jié)合。通過設(shè)計MIRA引物和CRISPR rna(crRNAs),多序列比較,優(yōu)化反應(yīng)條件,并使用熒光數(shù)值檢測裝置,驗證靈敏度和特異性。

并且qPCR結(jié)果作為比較對照,研究了160例臨床咽拭子樣本的檢測結(jié)果的一致性。

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(MIRA-CRISPR/Cas12a檢測法檢測步驟示意圖)


實驗結(jié)果

1. MIRA-CRISPR/Cas12a檢測方法靈敏度和特異性

MIRA方法檢測中,使用RSV-F1/R1引物對從RSV、ADV、PIV、RhV、MP、CP、FluB、hMPV、FluA或RSV/ADV合并感染患者的咽拭子樣本中擴增核酸。除RSV和ADV有擴增條帶,其他結(jié)果均為陰性,說明所選MIRA引物與檢測的其他8種病原體未發(fā)生交叉反應(yīng),且保守性良好。

隨后,使用無菌水對RSV和ADV重組質(zhì)粒進行10倍梯度稀釋,對RSV和ADV的檢測限均為106copies/mL。

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1-10:分別為RSV、RSV/ADV合并感染患者咽拭子樣本以及其他呼吸道病原體樣本

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1-6:107102稀釋質(zhì)粒DNA;7:陰性對照)

2.與qPCR做對比

qPCR方法相比,RSV和ADV的檢出限均為103copies/mL。

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(qPCR檢測RSV和ADV的靈敏度

       MIRA-CRISPR方法更適合基層實驗室,檢測時間短,操作簡單,無需大型qPCR儀器即可完成實驗操作。

3.臨床樣本對比

從急性呼吸道感染的兒童中采集咽拭子樣本160例。同時使用MIRA-CRISPR方法、qPCR方法進行檢測,并將結(jié)果與臨床試驗結(jié)果進行比較。

qPCR方法相比,MIRA-CRISPR方法RSV和ADV的敏感性分別為98.1%和91.4%,檢測特異性均為100%。Kappa值大于0.95,表明其一致性程度較高。

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MIRA-CRISPR方法對RSV和ADV的檢測具備快速、靈敏、特異性強的優(yōu)勢。它能及時準確地檢測到病毒感染,更加適合于醫(yī)療資源匱乏的地區(qū)使用。

(上述數(shù)據(jù)等信息均來源于原文,鏈接:http://weisiyin.cn/vip_doc/28304219.html)



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